《中国牡丹芍药基因库》建设项目总投资（一期工程）830万元，为国家林业局和甘肃省林业厅指定的重点花卉建设项目。目的是充分利用西北牡丹、芍药野生资源丰富和栽培品种优良，抗逆性强，适应性广的优势，广泛搜集，集中栽植，保护珍稀品种，立足中国，面向世界，建立全国最大的牡丹、芍药资源基因库。在保护和研究的同时，向国内外提供优质品种苗木。牡丹芍药基因库位于中川牡丹芍药园东侧，占地面积360亩，其中牡丹基因库与试验圃180亩，芍药基因库与试验圃120亩，鲜切花生产圃60亩。
      基因库中牡丹建立七个圃，即：⒈ 野生种质资源圃；⒉ 甘肃牡丹品种圃；⒊ 中原牡丹品种圃；⒋ 国外品种圃；⒌ 试验观察圃；⒍ 牡丹采穗圃；⒎ 优良品种繁育圃。  
      芍药建立五个圃，即：⒈ 野生种质资源圃；⒉ 中国栽培品种圃；⒊ 国外栽培品种圃；⒋ 优良品种繁育圃；⒌ 新品种繁育圃。 
      项目负责人为中国牡丹芍药协会副秘书长，兰州牡丹园艺开发公司总经理赵潜龙，项目技术负责人为中国牡丹芍药协会副会长，甘肃省林业厅副总工程师、牡丹专家李嘉珏。
      目前园内培育的芍药达到了300多个品种，已整理和鉴定的品种有165个，尚未鉴定的品种约有130多个，年产种苗5万多墩，鲜切花15万枝。

                   牡丹优良品种繁育圃                                                甘肃牡丹品种圃

                   芍药优良品种繁育圃                                               芍药新品种繁育圃